入驻京东集采的方式主要有三种：京东集采采销邀约入驻、入驻商家自荐入驻和第三方代入驻。具体入驻流程如下：

1. 在平台网站注册京东企业帐户。

2. 登陆自营供应商入驻系统，填写基本信息并签署在线协议。

3. 提交公司基本信息、财务信息、资质信息等资料。

4. 等待招商、分配、采销审核，期间可登录系统查看审核进度。

5. 完善信息，补全相关详细信息。

6. 采销再次审核，审核通过后即可成功入驻。

入驻京东集采需要满足一定的条件，包括企业一般纳税人资格、注册时间满2年、注册资本200万元及以上等。此外，京东集采是定向邀约入驻的，需要通过渠道拿到邀请名额才能入驻，商家自己是无法入驻的。

关于扣点，京东集采的扣点根据类目不同而有所差异，一般在6%-8%左右，全类目的一般是在7%左右。此外，京东集采对每笔交易会进行扣点，一般为5%，根据不同类目，扣点也是不一样的。

总的来说，入驻京东集采需要具备一定的实力和资质，并且需要按照规定的流程进行申请和审核。具体的扣点和费用还需要根据商家的实际情况而定。