京东自营店入驻流程及费用如下：

一、入驻流程：

1. 注册京东“个人账户”，以便于登入京东自营供应商入驻系统。

2. 在线签署协议，提交公司基本信息、财务和资质信息并保存。在这一步，需要填写公司信息、店铺信息，提交资质等。

3. 招商分配、采销审核。这个阶段可以登陆系统查看资料审核进度。

4. 完善京东自营入驻信息，填写更为详细的相关信息。

5. 采销再次审核，审核通过后，就会为京东自营供应商创建后台管理账号及合同。

6. 供应商根据后台管理账号登陆VC后台，完成相关信息的录入和确认。

7. 等待京东审核，审核通过后，进入“我的京东”，完善店铺信息，完成开店。

二、费用：

京东自营店的入驻费用包括保证金和平台服务费。其中，保证金根据店铺经营类目不同而有所差异，一般为10万元，其中5万元为平台使用费，5万元为保证金。平台服务费则根据销售额来收取，一般为销售额的百分比。具体费用可以在入驻时与京东进行协商。

以上信息仅供参考，具体流程和费用可能会因京东平台的更新而发生变化。建议在入驻前仔细阅读京东平台的相关规定和要求，并与京东客服或招商人员进行沟通和确认。